Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,131,934 A→G N169N (AAT→AAC)  flgA ← assembly protein for flagellar basal‑body periplasmic P ring

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,131,9340AG100.0% 680.3 / NA 232N169N (AAT→AAC) flgAassembly protein for flagellar basal‑body periplasmic P ring
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (232/0);  total (232/0)

Only 100 of 232 total aligned reads displayed.

TTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCT  >  W3110S.gb/1131902‑1131952
                                |                  
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ttGGCGCTAACCCCATAACCGCTGGCGATCACGTTGACGCGTTGTCCCGc   >  1:756394/1‑50 (MQ=38)
ttGGCGCTAACCCCATAACCGCTGGCGATCACGTTGACGCGTTGTCCCGc   >  1:1612054/1‑50 (MQ=38)
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ttGGCGCTAACCCCATAACCGCTGGCGATCACGTTGACGCGTTGTCCCGCt  >  1:577482/1‑51 (MQ=38)
ttGGCGCTAACCCCATAACCGCTGGCGATCACGTTGACGCGTTGTCCCGCt  >  1:568263/1‑51 (MQ=38)
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ttGGCGCTAACCCCATAACCGCTGGCGATCACGTTGACGCGTTGTCCCGCt  >  1:523601/1‑51 (MQ=38)
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ttGGCGCTAACCCCATAACAGCTGGCGATCACGTTGACGCGTTGTCCCGCt  >  1:409710/1‑51 (MQ=37)
                                |                  
TTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCT  >  W3110S.gb/1131902‑1131952

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑