Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,165,466 C→T H210H (CAC→CAT)  ycfN → thiamin kinase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,165,4660CT100.0% 304.0 / NA 106H210H (CAC→CAT) ycfNthiamin kinase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (106/0);  total (106/0)

Only 100 of 106 total aligned reads displayed.

TGGGTGGAAAATACTGAACAGCACCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGA  >  W3110S.gb/1165443‑1165503
                       |                                     
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCa                          >  1:593570/1‑37 (MQ=37)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCCCTCGCGCGAAGa  >  1:105573/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAg   >  1:331717/1‑60 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAg   >  1:1044589/1‑60 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:418733/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:616720/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:606539/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:602358/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:598541/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:582698/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:552937/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:543446/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:514616/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:503888/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:483615/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:478743/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:467899/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:702334/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:410236/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:399807/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:379236/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:367496/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:356802/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:352033/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:349320/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:333565/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:317521/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:882109/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:979762/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:975306/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:970422/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:969306/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:954756/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:94987/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:940304/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:933701/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:8996/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:896591/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:891411/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:644048/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:856797/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:853208/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:847653/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:841836/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:818075/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:81285/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:80474/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:775252/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:749972/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:713353/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:300159/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1159321/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1320107/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1305504/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1305287/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1299825/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1274305/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1266669/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1257455/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1214952/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1205954/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1179006/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1165289/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1330265/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1157624/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1148546/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1142335/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1120285/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1103745/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:107623/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1057366/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1048210/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1027130/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1025935/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1016298/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1533683/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:273998/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:239953/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:238120/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:225544/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:181441/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:170052/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1632207/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1613019/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1601829/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1585145/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1558149/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:153710/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1009385/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1520556/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1508806/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1457581/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1451284/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:143024/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1424769/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1400525/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1354835/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1345916/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGa  >  1:1343740/1‑61 (MQ=255)
tgggtggAAAATACTGACCAGCATCGGCAATTGGTCAATGACTATACCACTCGCGCGAAGa  >  1:816097/1‑61 (MQ=255)
                       |                                     
TGGGTGGAAAATACTGAACAGCACCGGCAATTGGTCAATGACTATGCCACTCGCGCGAAGA  >  W3110S.gb/1165443‑1165503

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑