Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,195,713 T→C E51E (GAA→GAG)  ymfB ← bifunctional thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase and thiamin pyrophosphate hydrolase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,195,7130TC100.0% 514.9 / NA 175E51E (GAA→GAG) ymfBbifunctional thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase and thiamin pyrophosphate hydrolase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (175/0);  total (175/0)

Only 100 of 175 total aligned reads displayed.

GTTGCGGCTGCGCGCTGATGCCGGTTTCTTCCCACAGTTCACGGGCGGCGGCTTCCACTAAG  >  W3110S.gb/1195676‑1195737
                                     |                        
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gtTGCGGCTGCGCGCTGATGCCGGTTTCTTCCCACAGCTCACGGGCGGCGGCTTCCACTAAg  >  1:55931/1‑62 (MQ=255)
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gtTGCGGCTGCGCGCTGATGCCGGTTACTTCCCACAGCTCAcgcgcg                 >  1:1076361/1‑47 (MQ=37)
                                     |                        
GTTGCGGCTGCGCGCTGATGCCGGTTTCTTCCCACAGTTCACGGGCGGCGGCTTCCACTAAG  >  W3110S.gb/1195676‑1195737

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑