Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,483,468 C→T R282R (CGC→CGT ynbD → predicted phosphatase, inner membrane protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,483,4680CT100.0% 342.0 / NA 120R282R (CGC→CGTynbDpredicted phosphatase, inner membrane protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/120);  total (0/120)

Only 100 of 120 total aligned reads displayed.

GGGAAACTACCGCCCGCCGTTTACTGGCTGACATTGCCCTGCCGCATCGGGATGTGGCTGTC  >  W3110S.gb/1483424‑1483485
                                            |                 
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                  gTTTACTGGCTGACATTGCCCTGGCGTATCGGGATGTGGCTGTc  <  1:565137/44‑1 (MQ=38)
                   tttACTGGCTGACATTGCCCTGGCGTATCGGGATGTGGCTGTc  <  1:21378/43‑1 (MQ=38)
                   tttACTGGCTGACATTGCCCTGGCGTATCGGGATGTGGCTGTc  <  1:96426/43‑1 (MQ=38)
                                            |                 
GGGAAACTACCGCCCGCCGTTTACTGGCTGACATTGCCCTGCCGCATCGGGATGTGGCTGTC  >  W3110S.gb/1483424‑1483485

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: