Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,495,785 T→A P534P (CCT→CCA)  trg → methyl‑accepting chemotaxis protein III, ribose and galactose sensor receptor

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,495,7850TA100.0% 646.4 / NA 222P534P (CCT→CCA) trgmethyl‑accepting chemotaxis protein III, ribose and galactose sensor receptor
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base A (0/222);  total (0/222)

Only 100 of 222 total aligned reads displayed.

ACATTCTGTGTCGGCAGAACCTCGCGGAGCGGGTGAACCAGTTAGTTTCGCTACGGTGTGAA  >  W3110S.gb/1495764‑1495825
                     |                                        
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aCATTCTGTGTCGGCAGAACCACGAGGAGCTGGTGAACCAGTTAGTTTTGCTACGGTGTGaa  <  1:41263/62‑1 (MQ=255)
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aCATTCTGTGTCGGCAGAACCACGAGGAGCTGGTGAACCAGTTAGTTTTGCTACGGTGTGaa  <  1:337406/62‑1 (MQ=255)
aCATTCTGTGTCGGCAGAACCACGAGGAGCTGGTGAACCAGTTAGTTTTGCTACGGTGTGaa  <  1:30965/62‑1 (MQ=255)
aCATTCTGTGTCGGCAGAACCACGAGGAGCTGGTGAACCAGTTAGTTTTGCTACGGTGTGaa  <  1:28908/62‑1 (MQ=255)
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aCATTCTGTGTCGGCAGAACCACGAGGAGCTGGTGAACCAGTTAGTTTTGCTACGGTGTGaa  <  1:262313/62‑1 (MQ=255)
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  aTTCTGTGTCGGCAGAACCACGAGGAGCTGGTGAACCAGTTAGTTTTGCTACGGTGTGaa  <  1:1516813/60‑1 (MQ=255)
   ttCTGTGTCGGCAGAACCACGAGGAGCTGGTGAACCAGTTAGTTTTGCTACGGTGTGaa  <  1:116319/59‑1 (MQ=255)
                     |                                        
ACATTCTGTGTCGGCAGAACCTCGCGGAGCGGGTGAACCAGTTAGTTTCGCTACGGTGTGAA  >  W3110S.gb/1495764‑1495825

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑