Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,495,812 C→T F543F (TTC→TTT)  trg → methyl‑accepting chemotaxis protein III, ribose and galactose sensor receptor

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,495,8120CT100.0% 647.8 / NA 225F543F (TTC→TTT) trgmethyl‑accepting chemotaxis protein III, ribose and galactose sensor receptor
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/225);  total (0/225)

Only 100 of 225 total aligned reads displayed.

ACATTCTGTGTCGGCAGAACCTCGCGGAGCGGGTGAACCAGTTAGTTTCGCTACGGTGTGAA  >  W3110S.gb/1495764‑1495825
                                                |             
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aCATTCTGTGTCGGCAGAACCACGAGGAGCTGGTGAACCAGTTAGTTTTGCTACGGTGTGaa  <  1:41520/62‑1 (MQ=255)
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aCATTCTGTGTCGGCAGAACCACGAGGAGCTGGTGAACCAGTTAGTTTTGCTACGGTGTGaa  <  1:364427/62‑1 (MQ=255)
aCATTCTGTGTCGGCAGAACCACGAGGAGCTGGTGAACCAGTTAGTTTTGCTACGGTGTGaa  <  1:348801/62‑1 (MQ=255)
aCATTCTGTGTCGGCAGAACCACGAGGAGCTGGTGAACCAGTTAGTTTTGCTACGGTGTGaa  <  1:342529/62‑1 (MQ=255)
aCATTCTGTGTCGGCAGAACCACGAGGAGCTGGTGAACCAGTTAGTTTTGCTACGGTGTGaa  <  1:300450/62‑1 (MQ=255)
aCATTCTGTGTCGGCAGAACCACGAGGAGCTGGTGAACCAGTTAGTTTTGCTACGGTGTGaa  <  1:262313/62‑1 (MQ=255)
aCATTCTGTGTCGGCAGAACCACGAGGAGCTGGTGAACCAGTTAGTTTTGCTACGGTGTGaa  <  1:249359/62‑1 (MQ=255)
aCATTCTGTGTCGGCAGAACCACGAGGAGCTGGTGAACCAGTTAGTTTTGCTACGGTGTGaa  <  1:504785/62‑1 (MQ=255)
aCATTCTGTGTCGGCAGAACCACGAGGAGCTGGTGAACCAGTTAGTTTTGCTACGGTGTGaa  <  1:235676/62‑1 (MQ=255)
aCATTCTGTGTCGGCAGAACCACGAGGAGCTGGTGAACCAGTTAGTTTTGCTACGGTGTGaa  <  1:1633412/62‑1 (MQ=255)
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 gaTTCTGTGTCTGCAGAACCACGAGGAGCTGGTGATCCAGTTAGTTTTGCTACGGTGTGaa  <  1:1552687/60‑1 (MQ=255)
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  aTTCTGTGTCGGCAGAACCACGAGGAGCTGGTGAACCAGTTAGTTTTGCTACGGTGTGaa  <  1:1516813/60‑1 (MQ=255)
       gtgtCGGCAGAACCACGAGGAGCTGGTGAACCAGTTAGTTTTGCTACGGTGTGaa  <  1:1117184/55‑1 (MQ=255)
                                                |             
ACATTCTGTGTCGGCAGAACCTCGCGGAGCGGGTGAACCAGTTAGTTTCGCTACGGTGTGAA  >  W3110S.gb/1495764‑1495825

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑