Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,738,444	T→C	A187A (GCA→GCG)	ydhP ←	predicted transporter

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,738,444	0	T	C	100.0%	160.6 / NA	56	A187A (GCA→GCG)	ydhP	predicted transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/56);  total (0/56)

CGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGTGCCCCTGCACCACCTTTAGGTAA  >  W3110S.gb/1738406‑1738467                                       |                        cgaaTTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:678583/59‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:634315/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1009006/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:278216/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:286629/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:289919/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:365644/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:443786/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:513843/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:534697/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:540079/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:542481/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:581226/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:587239/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:625762/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:273434/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:651616/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:660910/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:75198/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:753684/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:764863/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:770160/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:770246/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:818526/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:948960/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:970185/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:986563/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1269317/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1031444/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1036980/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1064085/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1069559/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1076959/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1083000/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:11296/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:113475/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1134873/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1144836/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1243352/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1245254/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:254625/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1275849/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1406719/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1412023/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1456803/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1466901/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1495451/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1544479/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1550027/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1551884/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1581259/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1652045/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:175683/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCCGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:1204278/62‑1 (MQ=255) cGCATTAATACCGCAAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:344154/62‑1 (MQ=255)                       ttttCACTTCAGGTCGCGCCCCTGCGCCACCTTTAGGTaa  <  1:661252/40‑1 (MQ=38)                                       |                        CGCATTAATACCGCCAGCTCTTTTTTCACTTCAGGTCGTGCCCCTGCACCACCTTTAGGTAA  >  W3110S.gb/1738406‑1738467

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑