Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,975,284 T→C L585L (TTA→TTG)  cheA ← fused chemotactic sensory histidine kinase (soluble) in two‑component regulatory system with CheB and CheY

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,975,2840TC100.0% 285.6 / NA 98L585L (TTA→TTG) cheAfused chemotactic sensory histidine kinase (soluble) in two‑component regulatory system with CheB and CheY
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (98/0);  total (98/0)

TTGTAAGATCACCACAATTCCCTGGGTGGCTTCGGTTTTCGCGCCCGCGACGTTGAACACTT  >  W3110S.gb/1975281‑1975342
   |                                                          
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   |                                                          
TTGTAAGATCACCACAATTCCCTGGGTGGCTTCGGTTTTCGCGCCCGCGACGTTGAACACTT  >  W3110S.gb/1975281‑1975342

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑