Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 168,305 C→T T274T (ACC→ACT fhuA → ferrichrome outer membrane transporter

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb168,3050CT100.0% 315.1 / NA 110T274T (ACC→ACTfhuAferrichrome outer membrane transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/110);  total (0/110)

Only 100 of 110 total aligned reads displayed.

CCGGAAACCGGTTATTACGGCTGGTTGCCGAAAGAGGGAACCGTTGAGCCGCTGCCGAACGG  >  W3110S.gb/168297‑168358
        |                                                     
ccGGTAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:783740/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:423932/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:53832/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:537929/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:534446/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:530719/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:525452/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:512268/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:489385/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:483712/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:468781/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:539553/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:344734/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:302244/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:280485/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:259848/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:189104/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:17491/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:174631/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1641259/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:16265/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:810872/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:975758/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:954234/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:947923/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:946903/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:932258/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:908574/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:891211/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:866383/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:836579/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1053216/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:790918/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:754662/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:749836/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:663190/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:617211/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:585454/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:584499/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:561864/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1306885/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1479986/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1468543/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1468145/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1468137/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1452468/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1327625/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1320468/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1092705/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1309015/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1618203/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1253113/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1241769/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1218712/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1201665/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:118648/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1158371/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1132268/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1130055/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1100465/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1577419/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:161983/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1553755/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1560827/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1578017/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1590165/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:150169/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1016001/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCAGCCAAACgg  <  1:183462/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGACGCTGCCAAACgg  <  1:1160212/62‑1 (MQ=255)
ccGGAAACTGGTTATTACGGCTGGATGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:146886/62‑1 (MQ=255)
 cGGAATCTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1530700/61‑1 (MQ=255)
 cGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGATAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:204321/61‑1 (MQ=255)
 cGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGGGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:772193/61‑1 (MQ=255)
 cGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:179780/61‑1 (MQ=255)
 cGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:829862/61‑1 (MQ=255)
 cGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:616547/61‑1 (MQ=255)
 cGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:759341/61‑1 (MQ=255)
 cGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:751787/61‑1 (MQ=255)
 cGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1297254/61‑1 (MQ=255)
 cGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1480948/61‑1 (MQ=255)
 cGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:615814/61‑1 (MQ=255)
 cGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:345264/61‑1 (MQ=255)
 cGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:597232/61‑1 (MQ=255)
 cGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:351318/61‑1 (MQ=255)
 cGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:364462/61‑1 (MQ=255)
 cGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:579608/61‑1 (MQ=255)
 cGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1084468/61‑1 (MQ=255)
 cGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:541705/61‑1 (MQ=255)
 cGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1392606/61‑1 (MQ=255)
 cGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:141298/61‑1 (MQ=255)
 cGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:968220/61‑1 (MQ=255)
 cGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:36697/61‑1 (MQ=255)
 cGGAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:377422/61‑1 (MQ=255)
  ggAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:984332/60‑1 (MQ=255)
  ggAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:608434/60‑1 (MQ=255)
  ggAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1330738/60‑1 (MQ=255)
  ggAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1413943/60‑1 (MQ=255)
  ggAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:452954/60‑1 (MQ=255)
   gAAACTGGTTATTACGGCTGGCTGCCGAAAGAGGGGACCGTTGAGCCGCTGCCAAACgg  <  1:1534933/59‑1 (MQ=38)
        |                                                     
CCGGAAACCGGTTATTACGGCTGGTTGCCGAAAGAGGGAACCGTTGAGCCGCTGCCGAACGG  >  W3110S.gb/168297‑168358

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: