Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,095,161 A→G L209L (TTA→TTG)  hisC → histidinol‑phosphate aminotransferase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,095,1610AG99.3% 389.8 / ‑5.7 135L209L (TTA→TTG) hisChistidinol‑phosphate aminotransferase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (1/0);  new base G (134/0);  total (135/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01

Only 100 of 135 total aligned reads displayed.

GGCTGGCTGGCGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTACGCACACTGTCGAAAGCTTTTGCTCT  >  W3110S.gb/2095126‑2095187
                                   |                          
ggctggcttgcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:328753/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCCCCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCtttt       >  1:1524056/1‑57 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGt                  >  1:948893/1‑46 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCg                >  1:1408785/1‑48 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGc           >  1:1199927/1‑53 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:378632/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:564745/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:550748/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:538909/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:535116/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:509046/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:472079/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:454658/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:452403/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:435498/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:395077/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:627032/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:354819/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:353777/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:341793/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:331550/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:305983/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1021801/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:296755/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:256456/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:813224/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:973184/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:970170/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:936458/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:92924/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:906791/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:903218/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:863255/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:838137/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:81856/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:814774/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:585934/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:804738/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:777827/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:764487/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:724198/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:712661/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:694337/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:688018/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:68512/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:683330/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:30489/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1350800/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1153810/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1393381/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1163435/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1171820/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1359950/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1359579/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:254094/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:135928/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1127683/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1339337/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1323459/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1321784/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1208809/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:124367/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:125067/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1296925/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1266991/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1057455/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1106588/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1467784/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1526354/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1538412/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1548836/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1578865/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:197960/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1603980/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1459142/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1627257/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:193142/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:187730/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1628823/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1639242/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctc   >  1:955155/1‑61 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctc   >  1:105805/1‑61 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctc   >  1:857266/1‑61 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctc   >  1:1098380/1‑61 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctc   >  1:594561/1‑61 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctc   >  1:747774/1‑61 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctc   >  1:727670/1‑61 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctc   >  1:1303068/1‑61 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctc   >  1:133632/1‑61 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctc   >  1:1364217/1‑61 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctc   >  1:51674/1‑61 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctc   >  1:504800/1‑61 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctc   >  1:1579152/1‑61 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctc   >  1:338376/1‑61 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGct    >  1:1255479/1‑60 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTTTGct    >  1:1609065/1‑60 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCTTATGctct  >  1:1442158/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGCCTTTGctct  >  1:240512/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTACGCACACTGTCGAAAGCTTTTGctct  >  1:1204288/1‑62 (MQ=255)
ggctggctggcGGAATATACGCACCTGGCTATTTTGCGCACACTGTCGAAAGc           >  1:5514/1‑53 (MQ=255)
                                   |                          
GGCTGGCTGGCGGAATATCCGCACCTGGCTATTTTACGCACACTGTCGAAAGCTTTTGCTCT  >  W3110S.gb/2095126‑2095187

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑