Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,145,967 C→A R189R (CGG→AGG)  yegE → predicted diguanylate cyclase, GGDEF domain signalling protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,145,9670CA100.0% 720.6 / NA 246R189R (CGG→AGG) yegEpredicted diguanylate cyclase, GGDEF domain signalling protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base A (0/246);  total (0/246)

Only 100 of 246 total aligned reads displayed.

ACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTT  >  W3110S.gb/2145962‑2146023
     |                                                        
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aCCCAAGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACGCTGACGTTAAGCTGGCtt  <  1:63358/62‑1 (MQ=255)
aCCCAAGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACGCTGACGTTAAGCTGGCtt  <  1:615321/62‑1 (MQ=255)
aCCCAAGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACGCTGACGTTAAGCTGGCtt  <  1:586350/62‑1 (MQ=255)
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aCCCAAGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACGCTGACGTTAAGCTGGCtt  <  1:548248/62‑1 (MQ=255)
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     |                                                        
ACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTT  >  W3110S.gb/2145962‑2146023

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: