Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,151,719 G→C G468G (GGC→GGG)  yegI ← conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,151,7190GC100.0% 363.8 / NA 125G468G (GGC→GGG) yegIconserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base C (125/0);  total (125/0)

Only 100 of 127 total aligned reads displayed.

TTTCGAGCATCGTCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGGCCGCCTACCTGCTGGATCTGGCGGA  >  W3110S.gb/2151682‑2151744
                                     |                         
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGcccgccca                    >  1:1212522/1‑43 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATc         >  1:461807/1‑56 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTggatg   >  1:566074/1‑59 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:554877/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:246036/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:514083/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:509400/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:48082/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:480325/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:466499/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:465572/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:429329/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:41773/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:39574/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:382568/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:377804/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:352189/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:347081/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:314629/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1027791/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:283053/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:277820/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:271623/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:294673/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:689806/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:962675/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:961894/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:959798/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:856770/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:856709/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:845790/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:788203/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:777271/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:733548/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:709979/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:565231/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:678320/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:66098/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:658113/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:656217/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:656134/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:65464/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:633760/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:629803/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:597722/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1251603/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1416903/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1404113/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:134457/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1339896/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1320876/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1314661/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1284845/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:128334/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1260944/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1255189/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:212344/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1235451/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1231637/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1195163/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1193689/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:112787/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1127306/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1109123/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1047952/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1045998/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1034065/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1460388/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:2368/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:207948/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:190186/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1622126/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1576047/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1574475/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1546367/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1528695/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1521047/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1516597/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1453025/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1482915/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:146514/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1482523/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGct    >  1:128336/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGct    >  1:208300/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGct    >  1:1391242/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGct    >  1:901825/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGct    >  1:1087272/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGct    >  1:456899/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGct    >  1:77511/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGct    >  1:755675/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGct    >  1:342806/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGct    >  1:1204263/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGct    >  1:349882/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGct    >  1:671647/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGct    >  1:1239071/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGct    >  1:415171/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGct    >  1:380157/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCAGGctg   >  1:114037/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCAGCCCAAGTGTTGGATCTGGct    >  1:741347/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTT‑‑AGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGCTGa  >  1:556919/1‑61 (MQ=255)
                                     |                         
TTTCGAGCATCGTCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGGCCGCCTACCTGCTGGATCTGGCGGA  >  W3110S.gb/2151682‑2151744

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑