Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,151,731 C→T Q464Q (CAG→CAA yegI ← conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,151,7310CT100.0% 361.2 / NA 125Q464Q (CAG→CAAyegIconserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (125/0);  total (125/0)

Only 100 of 125 total aligned reads displayed.

TTTCGAGCATCGTCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGGCCGCCTACCTGCTGGATCTGGCGGA  >  W3110S.gb/2151682‑2151744
                                                 |             
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tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:517966/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:514083/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:509400/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:480325/1‑60 (MQ=255)
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tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:465572/1‑60 (MQ=255)
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tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:580534/1‑60 (MQ=255)
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tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:709979/1‑60 (MQ=255)
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tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:747973/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:733548/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:314629/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:696101/1‑60 (MQ=255)
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tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:656134/1‑60 (MQ=255)
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tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:597722/1‑60 (MQ=255)
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tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1404113/1‑60 (MQ=255)
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tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1317599/1‑60 (MQ=255)
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tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1235451/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1231637/1‑60 (MQ=255)
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tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1193689/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:112787/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1127306/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1109123/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1047952/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1045998/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1034065/1‑60 (MQ=255)
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tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1576047/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:1453025/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGctg   >  1:155878/1‑60 (MQ=255)
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tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGct    >  1:1357244/1‑60 (MQ=255)
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tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGct    >  1:456899/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGct    >  1:671647/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCTGGct    >  1:1239071/1‑60 (MQ=255)
tttCGAGCATCGCCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGCCCGCCCAAGTGTTGGATCAGGctg   >  1:114037/1‑60 (MQ=255)
                                                 |             
TTTCGAGCATCGTCCGTTTGGCGATAAAACCTTCCAGGCCGCCTACCTGCTGGATCTGGCGGA  >  W3110S.gb/2151682‑2151744

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: