Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,157,414 C→T P5P (CCC→CCT)  mdtB → multidrug efflux system, subunit B

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,157,4140CT100.0% 572.9 / NA 198P5P (CCC→CCT) mdtBmultidrug efflux system, subunit B
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (198/0);  total (198/0)

Only 100 of 198 total aligned reads displayed.

TGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACC  >  W3110S.gb/2157407‑2157468
       |                                                      
tgtTACCTCCGATCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:1299427/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGcc                            >  1:1209437/1‑36 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTttatta                   >  1:1260751/1‑45 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTttatta                   >  1:1479744/1‑45 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTttatt                    >  1:1485724/1‑44 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTTTTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1367662/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:366502/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:490867/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:454478/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:438703/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:408960/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:399952/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:390812/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:36823/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:513573/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:33245/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:321949/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:31601/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:307625/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:293755/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:26961/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1000137/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:227742/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:188110/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:717272/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:983516/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:95667/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:954985/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:939531/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:937166/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:878327/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:824390/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:794102/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:757877/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:732907/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:499032/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:683959/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:679298/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:676189/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:631188/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:59636/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:564308/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:545221/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:526141/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:247799/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:128411/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1384300/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1357300/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1355365/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1317901/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1076803/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1094076/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1302379/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1123471/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1576985/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1277231/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1265042/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1235557/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1133779/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1189245/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1180025/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1163353/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1064509/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1004091/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1019088/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1530285/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1036740/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1500283/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1062564/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1491687/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1451947/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1424243/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1420861/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1415331/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccacc  >  1:1392200/1‑62 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:839899/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:860126/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:904193/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:728275/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:975448/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:1144437/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:1000171/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:708646/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:41653/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:1598632/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:1634309/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:1562893/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:1540678/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:249587/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:273773/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:340682/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:1407101/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:692602/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:1322886/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:487925/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:1294694/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:1223684/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:607992/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTCGccac   >  1:1177243/1‑61 (MQ=255)
tgtTACCTCAGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTttatta                   >  1:472122/1‑45 (MQ=38)
       |                                                      
TGTTACCCCCGAGCAGCACAGGCGGCCCGTCGCGCCTGTTTATTATGCGTCCTGTGGCCACC  >  W3110S.gb/2157407‑2157468

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑