| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | W3110S.gb | 2,195,242 | A→T | G105G (GGT→GGA) | yehD ← | predicted fimbrial‑like adhesin protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | W3110S.gb | 2,195,242 | 0 | A | T | 99.0% | 594.0 / ‑1.5 | 209 | coding (315/543 nt) | yehD | predicted fimbrial‑like adhesin protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (0/207); minor base . (0/2); total (0/209) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
ACGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTACCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAC > W3110S.gb/2195207‑2195269 | aCGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTT‑TCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:1357822/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:421600/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:604648/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:5689/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:561763/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:537836/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:521387/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:513614/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:506637/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:477951/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:470976/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:460756/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:443822/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:621067/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:420229/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:417404/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:403891/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:39521/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:376908/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:34360/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:324629/62‑1 (MQ=255) 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cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:1533793/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:1496328/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:148797/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:1484500/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:1470616/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:1461991/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:1443889/62‑1 (MQ=255) cGGTATCGTTGCCACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:299798/62‑1 (MQ=255) ggTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:1570713/61‑1 (MQ=255) gTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:1366701/60‑1 (MQ=255) tCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:700435/57‑1 (MQ=255) tACTGGCTATCGCCTTATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:1124470/50‑1 (MQ=255) tATCGTTTCCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAc < 1:643628/35‑1 (MQ=255) | ACGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTACCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAC > W3110S.gb/2195207‑2195269 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |