Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,213,980 A→T Y516F (TAT→TTT)  yehQ → hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,213,9800AT100.0% 246.5 / NA 86Y516F (TAT→TTT) yehQhypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base T (86/0);  total (86/0)

CCTTATGCCGTTGAACGCATGGCGGCGCTTTTGCAACAAACAGACGACCCCGTGTGTCTG  >  W3110S.gb/2213976‑2214035
    |                                                       
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CCTTATGCCGTTGAACGCATGGCGGCGCTTTTGCAACAAACAGACGACCCCGTGTGTCTG  >  W3110S.gb/2213976‑2214035

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: