Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,293,599 T→A intergenic (‑184/‑235) insH ← / → narP IS5 transposase and trans‑activator/DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with NarQ or NarX

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,293,5990TA100.0% 307.5 / NA 107intergenic (‑184/‑235)insH/narPIS5 transposase and trans‑activator/DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with NarQ or NarX
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base A (0/107);  total (0/107)

Only 100 of 107 total aligned reads displayed.

CGGAGTCAGTTTTTAAAAACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGATTTTTTAGTT  >  W3110S.gb/2293586‑2293647
             |                                                
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   aGTCAGTTTTAAAAAACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGATTTTTTAgtt  <  1:53684/59‑1 (MQ=255)
             |                                                
CGGAGTCAGTTTTTAAAAACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGATTTTTTAGTT  >  W3110S.gb/2293586‑2293647

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑