Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,384,411 C→T Q301Q (CAG→CAA)  menF ← isochorismate synthase 2

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,384,4110CT100.0% 508.1 / NA 176Q301Q (CAG→CAA) menFisochorismate synthase 2
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (176/0);  total (176/0)

Only 100 of 176 total aligned reads displayed.

ACGCAGTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTCTGGGTATCGGCCTGTAATCGTTGACAGA  >  W3110S.gb/2384378‑2384439
                                 |                            
gcgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1472839/2‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCTGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:742022/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGGCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:852960/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATc           >  1:521953/1‑53 (MQ=39)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCg          >  1:1449526/1‑54 (MQ=39)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGt         >  1:1466174/1‑55 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAg   >  1:951461/1‑61 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAg   >  1:514919/1‑61 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:474896/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:55555/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:545674/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:534922/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:497451/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:494872/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:490009/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:480884/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:580953/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:471421/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:456632/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:450029/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:4239/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:420345/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:418970/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:407395/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:392833/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:375463/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:344558/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:335056/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:831051/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:957643/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:932246/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:915066/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:911771/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:905152/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:899576/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:88523/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:882243/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:877626/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:866284/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:833456/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:559931/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:772812/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:765674/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:762939/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:74168/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:731526/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:726564/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:701451/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:631581/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:610195/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:597557/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:327639/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:120238/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:328291/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1351538/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1330270/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1323063/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1305626/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1284078/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1267888/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1265705/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1244614/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1231698/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1223928/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1409860/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1173279/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1170978/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:116339/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:112159/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1107675/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1098745/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1081605/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1069243/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1067066/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:103202/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1017364/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1633518/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1015262/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:317508/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:270618/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:259311/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:243635/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:231507/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:216583/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:204963/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:19217/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1645431/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1420122/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1620264/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1617551/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1587344/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1558684/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1500991/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:148238/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1445272/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1441195/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1429668/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1424481/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGACTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:194174/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACATGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1369991/1‑62 (MQ=255)
                                 |                            
ACGCAGTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTCTGGGTATCGGCCTGTAATCGTTGACAGA  >  W3110S.gb/2384378‑2384439

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑