Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,384,426 T→C L296L (TTA→TTG)  menF ← isochorismate synthase 2

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,384,4260TC100.0% 509.6 / NA 175L296L (TTA→TTG) menFisochorismate synthase 2
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (175/0);  total (175/0)

Only 100 of 175 total aligned reads displayed.

ACGCAGTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTCTGGGTATCGGCCTGTAATCGTTGACAGA  >  W3110S.gb/2384378‑2384439
                                                |             
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCTGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:742022/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATc           >  1:521953/1‑53 (MQ=39)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAg   >  1:951461/1‑61 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAg   >  1:1167361/1‑61 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAg   >  1:45434/1‑61 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAg   >  1:482436/1‑61 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAg   >  1:1623617/1‑61 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:471421/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:559931/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:557564/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:552773/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:534922/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:52152/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:503016/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:494872/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:490009/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:477644/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:629767/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:456632/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:443882/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:420345/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:418970/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:409930/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:393722/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:375463/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:344558/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:337749/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:833456/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:957643/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:932246/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:919007/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:911771/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:905152/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:899576/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:885888/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:882243/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:877626/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:866284/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:861872/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:580953/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:831051/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:772812/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:771280/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:762939/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:74168/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:739187/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:726564/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:701451/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:631581/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:327639/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:597557/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1227028/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1420122/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1410628/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1381162/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1360708/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1334115/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1330270/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1316995/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1289739/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1275806/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1267888/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1251229/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1241731/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1427329/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1223928/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1182124/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1173229/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:116339/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:111074/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1102015/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1081605/1‑62 (MQ=255)
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acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1067066/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:103202/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1017364/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1640094/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1015262/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:317508/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:297333/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:268085/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:252526/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:231507/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:216893/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:202121/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:19217/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1646757/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:330250/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1617551/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1588217/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1560508/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1507171/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:148238/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1473156/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1466277/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1462590/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1445272/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1441389/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:144037/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCAAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:210235/1‑62 (MQ=255)
                                                |             
ACGCAGTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTCTGGGTATCGGCCTGTAATCGTTGACAGA  >  W3110S.gb/2384378‑2384439

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑