Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 204,087 A→C E247A (GAA→GCA)  lpxB → tetraacyldisaccharide‑1‑P synthase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb204,0870AC100.0% 611.2 / NA 208E247A (GAA→GCA) lpxBtetraacyldisaccharide‑1‑P synthase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base C (208/0);  total (208/0)

Only 100 of 208 total aligned reads displayed.

GCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGAAGTCGCGCCAGACCTTTCAGTTCATTTGCT  >  W3110S.gb/204064‑204117
                       |                              
gtaGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:257224/3‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGTGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:1291794/1‑53 (MQ=255)
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gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGAc                   >  1:1497614/1‑37 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCtg                >  1:1395030/1‑39 (MQ=39)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTc              >  1:1640883/1‑42 (MQ=38)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTc              >  1:123526/1‑42 (MQ=38)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTc              >  1:897856/1‑42 (MQ=38)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGt           >  1:117068/1‑45 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGt           >  1:352893/1‑45 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCa        >  1:438139/1‑48 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCa        >  1:806566/1‑48 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCAt       >  1:786694/1‑49 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:339885/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:321419/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:240811/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:382465/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:318387/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:2246/1‑53 (MQ=255)
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gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:419205/1‑53 (MQ=255)
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gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:486181/1‑53 (MQ=255)
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gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:510217/1‑53 (MQ=255)
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gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:128676/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:127020/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:1227747/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:1219342/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:1205602/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:1188098/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:134603/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:1132147/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:1122986/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:1111150/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:1106501/1‑53 (MQ=255)
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gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:1054852/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:1041322/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:1026029/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:1017027/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:1536837/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:1002033/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:1609879/1‑53 (MQ=255)
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                       |                              
GCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGAAGTCGCGCCAGACCTTTCAGTTCATTTGCT  >  W3110S.gb/204064‑204117

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑