Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,384,435 A→G C293C (TGT→TGC)  menF ← isochorismate synthase 2

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,384,4350AG100.0% 506.6 / NA 172C293C (TGT→TGC) menFisochorismate synthase 2
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (172/0);  total (172/0)

Only 100 of 172 total aligned reads displayed.

ACGCAGTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTCTGGGTATCGGCCTGTAATCGTTGACAGA  >  W3110S.gb/2384378‑2384439
                                                         |    
gcgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1472839/2‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAg   >  1:951461/1‑61 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAg   >  1:741796/1‑61 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAg   >  1:1167361/1‑61 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAg   >  1:514919/1‑61 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAg   >  1:45434/1‑61 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAg   >  1:482436/1‑61 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:471421/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:56097/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:557564/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:55555/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:545674/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:533330/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:503016/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:494872/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:490009/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:477644/1‑62 (MQ=255)
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acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:456632/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:443882/1‑62 (MQ=255)
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acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:409930/1‑62 (MQ=255)
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acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:375463/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:354168/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:337749/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:833456/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:957643/1‑62 (MQ=255)
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acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:911771/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:905152/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:899576/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:885888/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:882243/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:877626/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:876702/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:861872/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:586284/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:831051/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:806711/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:771280/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:762939/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:748310/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:739187/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:726564/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:719750/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:666151/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:328291/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:610195/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1227028/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1420122/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1409860/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1351538/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1334115/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1323063/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1305626/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1284078/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1275806/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1265705/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1244614/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1241731/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1424481/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:120238/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1173279/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1173229/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:112159/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:111074/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1102015/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1081605/1‑62 (MQ=255)
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acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1633518/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1015262/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:319734/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:297333/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:268085/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:259311/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:243635/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:216893/1‑62 (MQ=255)
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acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:330250/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1620264/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1588217/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1587344/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1558684/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1500991/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:148238/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1462590/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1441389/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1441195/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1429668/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGACTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:194174/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACCTGCGGCGGTAAAACATCAAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:210235/1‑62 (MQ=255)
acgcagTACATGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTTTGGGTATCGGCCTGCAATCGTTGGCAGa  >  1:1369991/1‑62 (MQ=255)
                                                         |    
ACGCAGTACCTGCGGCGGTAAAACATCCAGCGTCTGGGTATCGGCCTGTAATCGTTGACAGA  >  W3110S.gb/2384378‑2384439

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑