Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,451,408 C→T L141L (CTG→TTA)  mepA ← murein DD‑endopeptidase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,451,4080CT100.0% 536.7 / NA 190L141L (CTG→TTA) mepAmurein DD‑endopeptidase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/190);  total (0/190)

Only 100 of 190 total aligned reads displayed.

CAACGTGTTTACCGTCGCGGGAAACTAAGTCCAGTGCTTGCGGGCGCAAGAGCTGCGCGGAGGT  >  W3110S.gb/2451377‑2451440
                               |                                
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   cGTGATTACCGTCGCGGGAAACTAAATCTAACGCTTGCGGGCGCAAGAGCTGCGCGGAGGt  <  1:628577/61‑1 (MQ=255)
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       tttACCGTCGCGGGAAACTAAATCTAACGCTTGCGGGCGCAAGAGCTGCGCGGAGGt  <  1:695982/57‑1 (MQ=255)
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                     aaaCTAAATCTAACGCTTGCGGGCGCAAGAGCTGCGCGGAGGt  <  1:869321/43‑1 (MQ=25)
                               |                                
CAACGTGTTTACCGTCGCGGGAAACTAAGTCCAGTGCTTGCGGGCGCAAGAGCTGCGCGGAGGT  >  W3110S.gb/2451377‑2451440

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑