Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 204,103 T→G L252L (CTT→CTG)  lpxB → tetraacyldisaccharide‑1‑P synthase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb204,1030TG100.0% 580.7 / NA 197L252L (CTT→CTG) lpxBtetraacyldisaccharide‑1‑P synthase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base G (197/0);  total (197/0)

Only 100 of 197 total aligned reads displayed.

GCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGAAGTCGCGCCAGACCTTTCAGTTCATTTGCT  >  W3110S.gb/204064‑204117
                                       |              
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gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTc              >  1:897856/1‑42 (MQ=38)
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gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCa        >  1:438139/1‑48 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCAt       >  1:110656/1‑49 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTg    >  1:1229060/1‑52 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:419205/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:452707/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:409653/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:466918/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:486181/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:382465/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:502473/1‑53 (MQ=255)
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gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:355411/1‑53 (MQ=255)
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gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:1004338/1‑53 (MQ=255)
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gCAGTTTGAAAGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:469032/1‑53 (MQ=255)
                                       |              
GCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGAAGTCGCGCCAGACCTTTCAGTTCATTTGCT  >  W3110S.gb/204064‑204117

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑