Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 204,106 A→G S253S (TCA→TCG)  lpxB → tetraacyldisaccharide‑1‑P synthase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb204,1060AG100.0% 558.1 / NA 190S253S (TCA→TCG) lpxBtetraacyldisaccharide‑1‑P synthase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (190/0);  total (190/0)

Only 100 of 190 total aligned reads displayed.

GCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGAAGTCGCGCCAGACCTTTCAGTTCATTTGCT  >  W3110S.gb/204064‑204117
                                          |           
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gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:355411/1‑53 (MQ=255)
gCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGCAGTCGCGCCAGACCTGTCGGTTCATTTGc   >  1:382465/1‑53 (MQ=255)
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                                          |           
GCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGAAGTCGCGCCAGACCTTTCAGTTCATTTGCT  >  W3110S.gb/204064‑204117

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑