Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,627,692 T→A intergenic (‑98/‑254) yfgF ← / → yfgG predicted inner membrane protein/hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,627,6920TA100.0% 806.1 / NA 278intergenic (‑98/‑254)yfgF/yfgGpredicted inner membrane protein/hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base A (0/278);  total (0/278)

Only 100 of 278 total aligned reads displayed.

CGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCATTGATTCTAAGTGTCAT  >  W3110S.gb/2627660‑2627708
                                |                
cGAATGTTGATTATTCTTCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1391020/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGATAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:336979/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:305330/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:504428/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:486989/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:443926/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:423809/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:398154/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:394541/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:384929/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:371574/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:366354/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:313252/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:519630/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:283414/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:262788/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:227907/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:221590/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:21519/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:201792/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:176795/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:171569/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:166642/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1007588/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1629336/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:782803/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:962708/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:940601/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:933422/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:912731/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:900109/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:872767/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:862952/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:828991/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:822091/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:802496/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:78731/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1643854/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:771790/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:734246/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:700825/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:678335/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:672102/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:658220/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:643385/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:61904/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:602237/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:575742/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:541834/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1151017/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1615869/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1278413/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1270066/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1256715/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1243575/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1236252/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1228597/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1210279/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1201534/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1179204/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1167749/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1161549/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1287665/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1143301/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1129833/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1128317/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1104590/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1094746/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1089385/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:10855/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1068543/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1062181/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1053584/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:10215/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1466404/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1602695/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1592332/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1570348/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1561163/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1533095/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1516516/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1510788/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1496358/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1489107/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1481225/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1296604/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1461780/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1432578/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1417696/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1368902/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1358646/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1347760/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1339173/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1327813/49‑1 (MQ=255)
cGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1310915/49‑1 (MQ=255)
 gAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:843664/48‑1 (MQ=255)
 gAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:881790/48‑1 (MQ=255)
 gAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:458081/48‑1 (MQ=255)
  aaTGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:1454977/47‑1 (MQ=255)
       tgatTATTCATCACTATAGAGAGCAATGATTCTAAGTGTCat  <  1:421116/42‑1 (MQ=255)
                                |                
CGAATGATGATTATTCATCACTATAGAGAGCATTGATTCTAAGTGTCAT  >  W3110S.gb/2627660‑2627708

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑