Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,638,524 A→G H236H (CAT→CAC)  hisS ← histidyl tRNA synthetase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,638,5240AG100.0% 362.4 / NA 125H236H (CAT→CAC) hisShistidyl tRNA synthetase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (0/125);  total (0/125)

Only 100 of 125 total aligned reads displayed.

CAGTTTGCACAGACCGGCAAAATGCTCACGAGATTCCTCGTCCAGATAGTCACCTAATGCCGG  >  W3110S.gb/2638503‑2638565
                     |                                         
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  gTTTGCACAGACCGGCAAAGTGCTCACGAGATTCCTCGTCCAGATAATCGCCTAATGCCgg  <  1:877247/61‑1 (MQ=255)
    ttGCACAGACCGGCAAAGTGCTCACGAGATTCCTCGTCCAGATAATCGCCTAATGCCgg  <  1:1597322/59‑1 (MQ=255)
         caGACCGGCAAAGTGCTCACGAGATTCCTCGTCCAGATAATCGCCTAATGCCgg  <  1:1553195/54‑1 (MQ=38)
                 cAAAGTGCTCACGAGATTCCTCGTCCAGATAATCGCCTAATGCCgg  <  1:804091/46‑1 (MQ=37)
                     |                                         
CAGTTTGCACAGACCGGCAAAATGCTCACGAGATTCCTCGTCCAGATAGTCACCTAATGCCGG  >  W3110S.gb/2638503‑2638565

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑