Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,638,551 G→A D227D (GAC→GAT)  hisS ← histidyl tRNA synthetase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,638,5510GA100.0% 362.5 / NA 126D227D (GAC→GAT) hisShistidyl tRNA synthetase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (0/126);  total (0/126)

Only 100 of 126 total aligned reads displayed.

CAGTTTGCACAGACCGGCAAAATGCTCACGAGATTCCTCGTCCAGATAGTCACCTAATGCCGG  >  W3110S.gb/2638503‑2638565
                                                |              
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 agTTTGCACAGACCGGCAAAGTGCTCACGAGATTCCTCGTCCAGATAATCGCCTAATGCCgg  <  1:1169227/62‑1 (MQ=255)
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 agTTTGCACAGACCGGCAAAGTGCTCACGAGATTCCTCGTCCAGATAATCGCCTAATGCCgg  <  1:1139638/62‑1 (MQ=255)
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 agTTTGCACAGACCGGCAAAGTGCTCACGAGATTCCTCGTCCAGATAATCGCCTAATGACgg  <  1:757791/62‑1 (MQ=255)
    ttGCACAGACCGGCAAAGTGCTCACGAGATTCCTCGTCCAGATAATCGCCTAATGCCgg  <  1:1597322/59‑1 (MQ=255)
         caGACCGGCAAAGTGCTCACGAGATTCCTCGTCCAGATAATCGCCTAATGCCgg  <  1:1553195/54‑1 (MQ=38)
                 cAAAGTGCTCACGAGATTCCTCGTCCAGATAATCGCCTAATGCCgg  <  1:804091/46‑1 (MQ=37)
                                                |              
CAGTTTGCACAGACCGGCAAAATGCTCACGAGATTCCTCGTCCAGATAGTCACCTAATGCCGG  >  W3110S.gb/2638503‑2638565

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑