Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,666,106 G→T R133R (CGA→AGA)  hcaT ← predicted 3‑phenylpropionic transporter

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,666,1060GT100.0% 375.0 / NA 130R133R (CGA→AGA) hcaTpredicted 3‑phenylpropionic transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base T (130/0);  total (130/0)

Only 100 of 130 total aligned reads displayed.

CAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCGCACTTTGCCGTAATCAAGC  >  W3110S.gb/2666065‑2666125
                                         |                   
cAGCGCCGAGCCAATGACGAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:419004/1‑61 (MQ=255)
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cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGCGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:81595/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCGCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1072196/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCTACAGTCTCACTTTGCCGTAATCa     >  1:1030436/1‑58 (MQ=39)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCa     >  1:495774/1‑58 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAg   >  1:598700/1‑60 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAg   >  1:163203/1‑60 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:33960/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:496699/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:491566/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:487199/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:448752/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:376698/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:352702/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:351332/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:347836/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:344175/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:584876/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:339365/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:331877/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:313896/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:273758/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:253065/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:248668/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:232326/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:225242/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:221652/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:764990/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:966884/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:956108/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:949265/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:937310/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:921529/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:919770/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:903787/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:891073/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:878388/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:801651/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:779529/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:521207/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:74242/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:718499/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:693250/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:658102/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:614669/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:606673/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:606567/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:590071/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:209477/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:559866/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1141290/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:135615/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1345186/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1338101/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1316542/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1297016/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1271861/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1264352/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1222490/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1219552/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1185370/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1168475/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1155159/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1366189/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1131354/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1125367/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1124678/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1124028/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1095751/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1088354/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1087355/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1069538/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:106323/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1014772/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1008311/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1522135/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:193981/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:191045/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:185835/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1636410/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1628014/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1580666/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1579437/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1573891/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1567879/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1001192/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1511423/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1492022/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:147692/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1472018/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1453600/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1438240/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1436912/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1397329/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:138563/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1371648/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAGCCAATGACAAAAGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:1396898/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGACCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCACTTTGCCGTAATCAAGc  >  1:296051/1‑61 (MQ=255)
cAGCGCCGAACCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCTCAc                  >  1:251695/1‑45 (MQ=38)
                                         |                   
CAGCGCCGAGCCAATGACAAACGCCACCGAGCCCCACAGTCGCACTTTGCCGTAATCAAGC  >  W3110S.gb/2666065‑2666125

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑