Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,843,724 G→A R468R (CGC→CGT)  hycE ← hydrogenase 3, large subunit

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,843,7240GA100.0% 346.8 / NA 121R468R (CGC→CGT) hycEhydrogenase 3, large subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (0/121);  total (0/121)

Only 100 of 121 total aligned reads displayed.

ATCGCCGCGCGGCGCTTCGGCAAAGCCCAGCGCAAAGCGGTGCGGAATGTAGGTAAAGCCTT  >  W3110S.gb/2843688‑2843749
                                    |                         
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gtcGCCGCGCGGCGCTTCGGCAAAGCCCAGCGCGAAACGGTGCGGAATGTAGGTAAAGCCtt  <  1:329001/61‑1 (MQ=37)
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 tcGCCGCGCGGCGCTTCGGCAAAGCCCAGCGCGAAACGGTGCGGAATGTAGGTAAAGCCtt  <  1:487607/61‑1 (MQ=255)
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 ccgccgcGCGGCGCTTCGGCAAAGCCCAGCGCGAAACGGTGCGGAATGTAGGTAAAGCCtt  <  1:212289/60‑1 (MQ=37)
   gccgcGCGGCGCTTCGGCAAAGCCCAGCGCGAAACGGTGCGGAATGTAGGTAAAGCCtt  <  1:552304/59‑1 (MQ=37)
   gccgcGCGGCGCTTCGGCAAAGCCCAGCGCGAAACGGTGCGGAATGTAGGTAAAGCCtt  <  1:540812/59‑1 (MQ=37)
   gccgcGCGGCGCTTCGGCAAAGCCCAGCGCGAAACGGTGCGGAATGTAGGTAAAGCCtt  <  1:1523543/59‑1 (MQ=37)
      gcgcgGCGCTTCGGCAAAGCCCAGCGCGAAACGGTGCGGAATGTAGGTAAAGCCtt  <  1:541987/56‑1 (MQ=37)
        gcggcgCTTCGGCAAAGCCCAGCGCGAAACGGTGCGGAATGTAGGTAAAGCCtt  <  1:1036319/54‑1 (MQ=37)
         cggcgCTTCGGCAAAGCCCAGCGCGAAACGGTGCGGAATGTAGGTAAAGCCtt  <  1:1096932/53‑1 (MQ=37)
           gcgcTTCGGCAAAGCCCAGCGCGAAACGGTGCGGAATGTAGGTAAAGCCtt  <  1:748447/51‑1 (MQ=37)
                 cGGCAAAGCCCAGCGCGAAACGGTGCGGAATGTAGGTAAAGCCtt  <  1:327563/45‑1 (MQ=38)
                                    |                         
ATCGCCGCGCGGCGCTTCGGCAAAGCCCAGCGCAAAGCGGTGCGGAATGTAGGTAAAGCCTT  >  W3110S.gb/2843688‑2843749

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑