Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,965,222 A→C T623T (ACT→ACG)  ptsP ← fused PEP‑protein phosphotransferase (enzyme I) of PTS system

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,965,2220AC100.0% 309.3 / NA 107T623T (ACT→ACG) ptsPfused PEP‑protein phosphotransferase (enzyme I) of PTS system
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base C (107/0);  total (107/0)

Only 100 of 107 total aligned reads displayed.

TTCGCCACCCGGGTATTGTTGCGATCAACGGCCAGAATGTATTGAGTCAGATCGTTGGTGCC  >  W3110S.gb/2965178‑2965239
                                            |                 
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                                            |                 
TTCGCCACCCGGGTATTGTTGCGATCAACGGCCAGAATGTATTGAGTCAGATCGTTGGTGCC  >  W3110S.gb/2965178‑2965239

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑