Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,968,584 G→A P89P (CCG→CCA)  mutH → methyl‑directed mismatch repair protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,968,5840GA99.0% 265.4 / ‑5.8 96P89P (CCG→CCA) mutHmethyl‑directed mismatch repair protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (1/0);  new base A (95/0);  total (96/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

GCTCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCGCTGGAAACAAC  >  W3110S.gb/2968534‑2968595
                                                  |           
tctctGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:503071/2‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTTAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:475001/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCGCTGGAaacaac  >  1:698039/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGaa       >  1:21934/1‑57 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:415479/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:658957/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:640465/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:621446/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:614145/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:606004/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:573639/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:540009/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:531244/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:431205/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:670820/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:386037/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:373164/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:365097/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:337012/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:333476/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:331459/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:322790/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:296100/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:280955/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1012307/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:839409/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:950371/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:944016/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:936897/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:932266/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:928454/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:910487/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:909974/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:897520/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:870972/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:870032/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:859236/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:266093/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:838747/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:822921/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:789951/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:776507/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:763407/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:737456/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:719111/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:710215/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:701775/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:694204/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1126354/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:240029/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1369445/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1350406/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1308715/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1287504/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1236728/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1197963/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1184275/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1180377/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1166752/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1151817/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1371787/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:111496/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1107982/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1099925/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1085389/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1084335/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1053653/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1051137/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1033348/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1023458/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1018577/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1569671/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:218825/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:195819/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:174019/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:163066/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1625909/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:161856/1‑62 (MQ=255)
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gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1570191/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1395088/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1567805/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1548070/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1534534/1‑62 (MQ=255)
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gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1520786/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1491548/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1486894/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1446795/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1420499/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:1419933/1‑62 (MQ=255)
gctCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaa   >  1:836361/1‑61 (MQ=255)
gctCTGGGCGTAGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCACTGGAaacaac  >  1:93515/1‑62 (MQ=255)
                                                  |           
GCTCTGGGCGTGGAACTTAAAACTATCCCTGTGGATAGTCTTGGTCGTCCGCTGGAAACAAC  >  W3110S.gb/2968534‑2968595

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑