Predicted mutation
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RA	W3110S.gb	3,016,550	C→A	A612D (GCT→GAT)	ygfK →	predicted oxidoreductase, Fe‑S subunit

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,016,550	0	C	A	100.0%	176.1 / NA	64	A612D (GCT→GAT)	ygfK	predicted oxidoreductase, Fe‑S subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base A (64/0);  total (64/0)

GTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAAT  >  W3110S.gb/3016505‑3016564                                              |               gTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCTCGATATCGATTTTGTTGCCGATCACGGCGTGAAAt  >  1:201386/1‑60 (MQ=255) gTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGATCAc            >  1:900316/1‑50 (MQ=255) gTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGATCAc            >  1:1623289/1‑50 (MQ=255) gTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGATCACGGCGTGaaa   >  1:1303122/1‑59 (MQ=255) gTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGATCACGGCGTGAAAt  >  1:515390/1‑60 (MQ=255) gTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGATCACGGCGTGAAAt  >  1:331336/1‑60 (MQ=255) gTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGATCACGGCGTGAAAt  >  1:511309/1‑60 (MQ=255) gTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGATCACGGCGTGAAAt  >  1:504679/1‑60 (MQ=255) gTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGATCACGGCGTGAAAt  >  1:493867/1‑60 (MQ=255) 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                                             |               GTATTCCTGCAGAGTTAATTCAGCACGATATCGATTTTGTTGCCGCTCACGGCGTGAAAT  >  W3110S.gb/3016505‑3016564

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑