Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,095,043 A→G N2S (AAT→AGT)  yggU → conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,095,0430AG100.0% 298.0 / NA 103N2S (AAT→AGT) yggUconserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (0/103);  total (0/103)

Only 100 of 103 total aligned reads displayed.

ATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGC  >  W3110S.gb/3095039‑3095100
    |                                                         
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 tGAGTGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAagc  <  1:298007/61‑1 (MQ=255)
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ATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGC  >  W3110S.gb/3095039‑3095100

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑