Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,168,189 A→G T48T (ACT→ACC)  ygiW ← conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,168,1890AG100.0% 297.0 / NA 103T48T (ACT→ACC) ygiWconserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (0/103);  total (0/103)

Only 100 of 103 total aligned reads displayed.

CACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACAGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCG  >  W3110S.gb/3168164‑3168225
                         |                                    
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTTCGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:333552/62‑1 (MQ=255)
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cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTTGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:526760/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAAtcctcca  <  1:1191890/62‑2 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:308249/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:441091/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:430613/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:422437/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:41765/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:412531/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:398090/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:384799/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:328510/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:462139/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:297782/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:297060/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:282155/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:269401/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:263836/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:22485/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:205345/62‑1 (MQ=255)
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cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1005833/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:192477/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:186729/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:620225/62‑1 (MQ=255)
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cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:91854/62‑1 (MQ=255)
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cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:762283/62‑1 (MQ=255)
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cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:458023/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:619606/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:588425/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:58030/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:535658/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:526978/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:494208/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:490951/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:474829/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:472850/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:196420/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1149442/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1410893/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:138658/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:135366/62‑1 (MQ=255)
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cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1334151/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1333302/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1294524/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1275728/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1248492/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1223922/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1156829/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:166107/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1132277/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:112092/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1106899/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1105758/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1105349/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1072197/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1065380/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1047985/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1039002/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1033803/62‑1 (MQ=255)
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cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1600071/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1587482/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:157507/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1562617/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1628479/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1542841/62‑1 (MQ=255)
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cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1632522/62‑1 (MQ=255)
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cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTCCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1354872/62‑1 (MQ=255)
cACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGGCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:636653/62‑1 (MQ=255)
 aCGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1625349/61‑1 (MQ=255)
 aCGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1151006/61‑1 (MQ=255)
 aCGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:219239/61‑1 (MQ=255)
 aCGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:968905/61‑1 (MQ=255)
 aCGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1446363/61‑1 (MQ=255)
 aCGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1559400/61‑1 (MQ=255)
 aCGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:49179/61‑1 (MQ=255)
         aTTTTGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:1371707/53‑1 (MQ=255)
            ttGCGCTTTCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:455284/50‑1 (MQ=255)
                    tCTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTTGAATCCTCCg  <  1:1491569/42‑1 (MQ=38)
                     cTACGGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCg  <  1:317334/41‑1 (MQ=255)
                         |                                    
CACGCAGGGATTTTGCGCTTTCTACAGTCGTTACGCTGCCGTTCGGCCCCTGGAATCCTCCG  >  W3110S.gb/3168164‑3168225

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑