Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,222,392 T→C N368N (AAT→AAC)  ebgA → cryptic beta‑D‑galactosidase, alpha subunit

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,222,3920TC99.5% 550.2 / NA 188N368N (AAT→AAC) ebgAcryptic beta‑D‑galactosidase, alpha subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  major base C (0/187);  minor base G (0/1);  total (0/188)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 190 total aligned reads displayed.

GATCTCCAGTTGATGAAGCAGCACAATATCAACTCCGTGCGTACCGCTCACTACCCGAACGA  >  W3110S.gb/3222366‑3222427
                          |                                   
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  tctcCAGTTGATGAAGCAGCACAACATCAACTCCGTGCGTACCGCTCACTACCCGAACGa  <  1:37870/60‑1 (MQ=255)
          tgatgaAGCAGCACAACATCAACTCCGTGCGTACCGCTCACTACCCGAACGa  <  1:1011048/52‑1 (MQ=255)
                          |                                   
GATCTCCAGTTGATGAAGCAGCACAATATCAACTCCGTGCGTACCGCTCACTACCCGAACGA  >  W3110S.gb/3222366‑3222427

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑