Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,294,438	T→C	L395S (TTG→TCG)	yraM →	conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,294,438	0	T	C	100.0%	71.1 / NA	26	L395S (TTG→TCG)	yraM	conserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/26);  total (0/26)

GGTCGGTCCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTTGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAC  >  W3110S.gb/3294403‑3294463                                    |                          ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:121629/61‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:986039/61‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:8722/61‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:798855/61‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:787270/61‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:711130/61‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:578025/61‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:428348/61‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:404241/61‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:262463/61‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:228986/61‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:192957/61‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:1565412/61‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:1563032/61‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:1515246/61‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:1500384/61‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:1475492/61‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:1466276/61‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:1465390/61‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:1409630/61‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:1399617/61‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:1351533/61‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:1230413/61‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:1206078/61‑1 (MQ=255) gggcggtcCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:1584467/58‑1 (MQ=255)               tGAAAAATAACGTTGAAGAGTCGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAc  <  1:722917/47‑1 (MQ=255)                                    |                          GGTCGGTCCGTTGCTGAAAAATAACGTTGAAGAGTTGCTGAAGAGCAACACTCCGCTGAAC  >  W3110S.gb/3294403‑3294463

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑