Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,421,540	C→T	H121Y (CAT→TAT)	yhdY →	predicted amino‑acid transporter subunit

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,421,540	0	C	T	100.0%	54.1 / NA	21	H121Y (CAT→TAT)	yhdY	predicted amino‑acid transporter subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/21);  total (0/21)

TTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACT  >  W3110S.gb/3421522‑3421583                   |                                            ttCTGGAAAATACTCCCGTATCGCGGTCGCTATATTGCGGTCTGGGCGGTGATTTACCCACt  <  1:1374730/62‑1 (MQ=255) ttCTGGAAAATACTCCCGTATCGCGGTCGCTATATTGCGGTATGGGCTGTGATTTACCCACt  <  1:362455/62‑1 (MQ=255) ttCTGGAAAATACTCCCGTATCGCGGTCGCTATATTGCGGTATGGGCGGTGATTTACCCACt  <  1:155262/62‑1 (MQ=255) ttCTGGAAAATACTCCCGTATCGCGGTCGCTATATTGCGGTATGGGCGGTGATTTACCCACt  <  1:943175/62‑1 (MQ=255) ttCTGGAAAATACTCCCGTATCGCGGTCGCTATATTGCGGTATGGGCGGTGATTTACCCACt  <  1:770518/62‑1 (MQ=255) ttCTGGAAAATACTCCCGTATCGCGGTCGCTATATTGCGGTATGGGCGGTGATTTACCCACt  <  1:723570/62‑1 (MQ=255) ttCTGGAAAATACTCCCGTATCGCGGTCGCTATATTGCGGTATGGGCGGTGATTTACCCACt  <  1:639719/62‑1 (MQ=255) ttCTGGAAAATACTCCCGTATCGCGGTCGCTATATTGCGGTATGGGCGGTGATTTACCCACt  <  1:490062/62‑1 (MQ=255) ttCTGGAAAATACTCCCGTATCGCGGTCGCTATATTGCGGTATGGGCGGTGATTTACCCACt  <  1:212276/62‑1 (MQ=255) ttCTGGAAAATACTCCCGTATCGCGGTCGCTATATTGCGGTATGGGCGGTGATTTACCCACt  <  1:200795/62‑1 (MQ=255) ttCTGGAAAATACTCCCGTATCGCGGTCGCTATATTGCGGTATGGGCGGTGATTTACCCACt  <  1:1572093/62‑1 (MQ=255) ttCTGGAAAATACTCCCGTATCGCGGTCGCTATATTGCGGTATGGGCGGTGATTTACCCACt  <  1:1052310/62‑1 (MQ=255) ttCTGGAAAATACTCCCGTATCGCGGTCGCTATATTGCGGTATGGGCGGTGATTTACCCACt  <  1:1551901/62‑1 (MQ=255) ttCTGGAAAATACTCCCGTATCGCGGTCGCTATATTGCGGTATGGGCGGTGATTTACCCACt  <  1:1506106/62‑1 (MQ=255) ttCTGGAAAATACTCCCGTATCGCGGTCGCTATATTGCGGTATGGGCGGTGATTTACCCACt  <  1:1484456/62‑1 (MQ=255) ttCTGGAAAATACTCCCGTATCGCGGTCGCTATATTGCGGTATGGGCGGTGATTTACCCACt  <  1:1350224/62‑1 (MQ=255) ttCTGGAAAATACTCCCGTATCGCGGTCGCTATATTGCGGTATGGGCGGTGATTTACCCACt  <  1:1268323/62‑1 (MQ=255) ttCTGGAAAATACTCCCGTATCGCGGTCGCTATATTGCGGTATGGGCGGTGATTTACCCACt  <  1:1210871/62‑1 (MQ=255) ttCTGGAAAATACTCCCGTATCGCGGTCGCTATATTGCGGTATGGGCGGTGATTTACCCACt  <  1:1155088/62‑1 (MQ=255) ttCTGGAAAATACTCCCGTATCGCGGTCGCTATATTGCGGTATGGGCGGTGATTTACCCACt  <  1:1085912/62‑1 (MQ=255) ttCTCGAAAATACTCCCGTATCGCGGTCGCTATATTGCGGTATGGGCGGTGATTTACCCACt  <  1:179376/62‑1 (MQ=255)                   |                                            TTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACT  >  W3110S.gb/3421522‑3421583

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑