Predicted mutation
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RA	W3110S.gb	411,271	C→T	P145P (CCG→CCA)	araJ ←	predicted transporter

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	411,271	0	C	T	100.0%	204.5 / NA	74	P145P (CCG→CCA)	araJ	predicted transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/74);  total (0/74)

AATACGTTCCCAGCGGAATGCCCAGCAAATTGGCGACTGTCATCCCGGAAACCATCCCCGC  >  W3110S.gb/411258‑411318              |                                                aaTACGTT‑CCAGTGGAATGCCCAGCAAATTGGCGACTGTCATCCCGGAAACCATCCCTGc  <  1:1118722/60‑1 (MQ=255)  aTACGTTCTCAGTGGAATGCCCAGCAAATTGGCGACTGTCATCCCGGAAACCATCCCTGc  <  1:254641/60‑1 (MQ=255)  aTACGTTCCCAGTGTAATGCCCAGCAAATTGGCGACTGTCATCCCGGAAACCATCCCTGc  <  1:17922/60‑1 (MQ=255)  aTACGTTCCCAGTGGAATGCCCAGCAAATTGGCGACTGTCATCTCGGAAACCATCCCTGc  <  1:987843/60‑1 (MQ=255)  aTACGTTCCCAGTGGAATGCCCAGCAAATTGGCGACTGTCATCCCGGAAACCATCCCTGc  <  1:300214/60‑1 (MQ=255)  aTACGTTCCCAGTGGAATGCCCAGCAAATTGGCGACTGTCATCCCGGAAACCATCCCTGc  <  1:546027/60‑1 (MQ=255)  aTACGTTCCCAGTGGAATGCCCAGCAAATTGGCGACTGTCATCCCGGAAACCATCCCTGc  <  1:543523/60‑1 (MQ=255)  aTACGTTCCCAGTGGAATGCCCAGCAAATTGGCGACTGTCATCCCGGAAACCATCCCTGc  <  1:52300/60‑1 (MQ=255)  aTACGTTCCCAGTGGAATGCCCAGCAAATTGGCGACTGTCATCCCGGAAACCATCCCTGc  <  1:481538/60‑1 (MQ=255) 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AATACGTTCCCAGCGGAATGCCCAGCAAATTGGCGACTGTCATCCCGGAAACCATCCCCGC  >  W3110S.gb/411258‑411318

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑