Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,442,144 C→T A521A (GCC→GCT)  thiC → thiamin (pyrimidine moiety) biosynthesis protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,442,1440CT100.0% 548.7 / NA 190A521A (GCC→GCT) thiCthiamin (pyrimidine moiety) biosynthesis protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (190/0);  total (190/0)

Only 100 of 190 total aligned reads displayed.

TGTTAAGCAGGGGCTTATCACCTATAAGATTGCTGCCCACGCCGCTGACCTGGCGAAAGGGC  >  W3110S.gb/3442108‑3442169
                                    |                         
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tGTTAAACAGGCGCTTATCACCTATAAGATTGCCGCTCACGCCGCCGACCTGGCGAAAGGGc  >  1:1069275/1‑62 (MQ=255)
                                    |                         
TGTTAAGCAGGGGCTTATCACCTATAAGATTGCTGCCCACGCCGCTGACCTGGCGAAAGGGC  >  W3110S.gb/3442108‑3442169

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑