Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,442,153 T→C A524A (GCT→GCC)  thiC → thiamin (pyrimidine moiety) biosynthesis protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,442,1530TC100.0% 542.1 / NA 187A524A (GCT→GCC) thiCthiamin (pyrimidine moiety) biosynthesis protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (187/0);  total (187/0)

Only 100 of 187 total aligned reads displayed.

TGTTAAGCAGGGGCTTATCACCTATAAGATTGCTGCCCACGCCGCTGACCTGGCGAAAGGGC  >  W3110S.gb/3442108‑3442169
                                             |                
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                                             |                
TGTTAAGCAGGGGCTTATCACCTATAAGATTGCTGCCCACGCCGCTGACCTGGCGAAAGGGC  >  W3110S.gb/3442108‑3442169

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑