Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,459,280 T→C E15G (GAA→GGA)  secE ← preprotein translocase membrane subunit

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,459,2800TC100.0% 140.3 / NA 50E15G (GAA→GGA) secEpreprotein translocase membrane subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (50/0);  total (50/0)

GGAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTTCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCT  >  W3110S.gb/3459245‑3459306
                                   |                          
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCTCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:244846/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCtt           >  1:744830/1‑53 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAgat  >  1:1165035/1‑60 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGc   >  1:955347/1‑61 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGc   >  1:598047/1‑61 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:384060/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:375298/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:388743/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:430783/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:479687/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:540559/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:558478/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:607710/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:688999/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:719555/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:726522/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:736696/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:742515/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:762212/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:768519/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:783951/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:830505/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:889951/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:944419/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:949832/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:951711/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:1420749/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:1147619/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:1175929/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:1177483/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:1179144/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:1213176/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:1219921/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:1308033/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:1362235/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:1378334/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:1112241/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:1461132/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:150933/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:1140083/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:1605528/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:163786/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:234378/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:240491/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:273745/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:300040/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:1124685/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCATGa     >  1:1393879/1‑59 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTCACAGGCCGCGCCCGCTTCCTAGAGCt  >  1:318725/1‑62 (MQ=255)
ggAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATAGCTCCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCt  >  1:634160/1‑62 (MQ=255)
                                   |                          
GGAGCAATGCCACCACAACGACCCACTTCATCGCTTCCAGGCCGCGCCCGCTTCCTTGAGCT  >  W3110S.gb/3459245‑3459306

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: