Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,495,938 C→T S493S (TCC→TCT)  ptsA → fused predicted PTS enzymes Hpr component, enzyme I component, and enzyme IIA component

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,495,9380CT100.0% 792.6 / NA 272S493S (TCC→TCT) ptsAfused predicted PTS enzymes Hpr component, enzyme I component, and enzyme IIA component
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (272/0);  total (272/0)

Only 100 of 272 total aligned reads displayed.

TTGTTTACCACGCAGCTACGGTCGATCCTCCGCGCCTCCGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAT  >  W3110S.gb/3495900‑3495961
                                      |                       
ttgttTACCTCACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:736980/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACg                  >  1:339407/1‑46 (MQ=37)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATc    >  1:147737/1‑60 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCa   >  1:1575992/1‑61 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCa   >  1:1383346/1‑61 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCa   >  1:614330/1‑61 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCa   >  1:600616/1‑61 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCa   >  1:404793/1‑61 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCa   >  1:983812/1‑61 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCa   >  1:1078430/1‑61 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCa   >  1:358521/1‑61 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:513345/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:278199/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:343061/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:600172/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:586441/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:576076/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:560278/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:528012/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:385896/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:490199/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:484241/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:477152/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:328908/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:466842/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:434755/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:42828/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:423122/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:364200/1‑62 (MQ=255)
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ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:964882/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:955314/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:938607/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:928870/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:92468/1‑62 (MQ=255)
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ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:885729/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:863520/1‑62 (MQ=255)
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ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:636662/1‑62 (MQ=255)
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ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:797912/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:781478/1‑62 (MQ=255)
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ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:745128/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:715584/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:702339/1‑62 (MQ=255)
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ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:686439/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:676728/1‑62 (MQ=255)
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ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:287373/1‑62 (MQ=255)
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ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:1303146/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:1296727/1‑62 (MQ=255)
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ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:1182380/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:1167458/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:116494/1‑62 (MQ=255)
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ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:1109825/1‑62 (MQ=255)
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ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:1497822/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:1487128/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAt  >  1:1470852/1‑62 (MQ=255)
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ttgttTACCACACAACTACGGTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGACTGAAAATCAt  >  1:1013165/1‑62 (MQ=255)
ttgttTACAACACAACTACGTTCGATCCTGCGCGCCTCTGCTCACGGCAGCCTGAAAATCa   >  1:691207/1‑61 (MQ=255)
                                      |                       
TTGTTTACCACGCAGCTACGGTCGATCCTCCGCGCCTCCGCTCACGGCAGCCTGAAAATCAT  >  W3110S.gb/3495900‑3495961

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑