Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,516,788 C→T L153L (CTG→TTG)  menA → 1,4‑dihydroxy‑2‑naphthoate octaprenyltransferase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,516,7880CT100.0% 422.6 / NA 146L153L (CTG→TTG) menA1,4‑dihydroxy‑2‑naphthoate octaprenyltransferase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (146/0);  total (146/0)

Only 100 of 146 total aligned reads displayed.

ATCACCTACACCGTGGGCAATCGTCCTTATGGTTATATCGGTCTGGGTGATATTTCCGTACT  >  W3110S.gb/3516746‑3516807
                                          |                   
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                                          |                   
ATCACCTACACCGTGGGCAATCGTCCTTATGGTTATATCGGTCTGGGTGATATTTCCGTACT  >  W3110S.gb/3516746‑3516807

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑