Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,748,515 G→A L156L (CTC→CTT)  tnaB ← tryptophan transporter of low affinity

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,748,5150GA100.0% 524.1 / NA 182L156L (CTC→CTT) tnaBtryptophan transporter of low affinity
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (182/0);  total (182/0)

Only 100 of 182 total aligned reads displayed.

CCCGAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTAACCACAATACGCTGGCA  >  W3110S.gb/3748512‑3748572
   |                                                         
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACtt                    >  1:1505082/1‑43 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACg        >  1:646323/1‑55 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACg        >  1:439844/1‑55 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGc   >  1:36453/1‑60 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGc   >  1:1602998/1‑60 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:465640/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:581229/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:578314/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:566342/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:544971/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:538410/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:509724/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:508103/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:498749/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:487747/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:483931/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:598434/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:453754/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:449951/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:413787/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:388099/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:38357/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:349335/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:340012/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:323854/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:318225/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:749381/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:983788/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:946170/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:942955/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:939083/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:893542/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:873814/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:868971/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:82030/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:816585/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:808444/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:791271/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:778041/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:584796/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:745282/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:720327/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:704503/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:673731/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:668068/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:657583/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:637962/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:635077/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:625793/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:613524/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:310711/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1155056/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1356266/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1355718/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1319245/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1301234/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1266038/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1247598/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1231438/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1212516/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1205019/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1196603/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1185904/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1367471/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1150144/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1146531/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1130554/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1113404/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1084966/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1057912/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1049077/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1042316/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1033150/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1027691/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1023256/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1583488/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:295205/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:289601/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:2621/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:213109/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:19121/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:166666/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1624500/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1608519/1‑61 (MQ=255)
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cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1588125/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1018080/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:154661/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1522222/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1496458/1‑61 (MQ=255)
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cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1472345/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:147123/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1466706/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:141953/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1408040/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1385045/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:1375097/1‑61 (MQ=255)
cccAAGGAACAATGAGGTAATACCACTGGCGGCTAACGAACTTATCCACAATACGCTGGCa  >  1:969227/1‑61 (MQ=255)
   |                                                         
CCCGAGGAACAATGAGGTAATACGACTGGCGGCTAACGAACTTAACCACAATACGCTGGCA  >  W3110S.gb/3748512‑3748572

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑