Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,799,452 T→C L314L (TTG→CTG)  yicM → predicted transporter

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,799,4520TC99.4% 473.9 / NA 165L314L (TTG→CTG) yicMpredicted transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  major base C (164/0);  minor base A (1/0);  total (165/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 165 total aligned reads displayed.

CCTGGCGGGATTCGGCGTGGATGGCTTAACGCTGGTGCTGTTGAGTTTTGGTATCGCCAGCT  >  W3110S.gb/3799412‑3799473
                                        |                     
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGc       >  1:376883/2‑57 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGc       >  1:383972/2‑57 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAg    >  1:948089/2‑60 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGc   >  1:84071/2‑61 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGc   >  1:1369130/2‑61 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGc   >  1:721659/2‑61 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGc   >  1:731057/2‑61 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGc   >  1:471001/2‑61 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGc   >  1:808245/2‑61 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGc   >  1:1237033/2‑61 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGc   >  1:111711/2‑61 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGc   >  1:266171/2‑61 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGc   >  1:358080/2‑61 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGc   >  1:561315/2‑61 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:441013/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:513037/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:507306/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:496923/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:476181/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:465991/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:537976/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:45672/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:455896/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:445448/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:647451/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:432305/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:419356/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:395623/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:373641/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:333592/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:759010/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:986389/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:942609/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:873960/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:872058/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:865924/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:846303/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:841373/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:823369/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:808319/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:780320/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:553219/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:757765/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:700141/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:696225/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:670528/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:649693/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:297307/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:639808/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:625961/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:589772/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1272709/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1464421/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1453013/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1445806/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1434154/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1428525/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1400585/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1362894/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1335748/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1328995/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1315175/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1283368/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1007093/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1264874/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1260216/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1211906/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1173386/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1160559/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1123267/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1115538/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1078947/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1066142/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1060611/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1605423/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1012654/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:287551/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:286477/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:242131/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:240710/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:23692/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:210309/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:178389/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1649182/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1646167/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1642766/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1621652/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1471056/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1596981/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1591552/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1591414/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:156584/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1550674/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1524163/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1502787/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:1491437/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGATGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:693370/2‑62 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTCCTGCTGAGTTTTGGTATCTCCAGc   >  1:1551493/2‑61 (MQ=255)
tcTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCCTGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCGCCAGCt  >  1:634551/2‑62 (MQ=255)
acTGGCGGGATTCGGTGTTGATGGCTTAACCCTGGTGCTGCTGAGTTTTGGTATCACCAGCt  >  1:348822/2‑62 (MQ=255)
                                        |                     
CCTGGCGGGATTCGGCGTGGATGGCTTAACGCTGGTGCTGTTGAGTTTTGGTATCGCCAGCT  >  W3110S.gb/3799412‑3799473

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑