Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,948,292 A→G P161P (CCA→CCG)  bcsB → regulator of cellulose synthase, cyclic di‑GMP binding

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,948,2920AG100.0% 572.5 / NA 200P161P (CCA→CCG) bcsBregulator of cellulose synthase, cyclic di‑GMP binding
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (0/200);  total (0/200)

Only 100 of 200 total aligned reads displayed.

AACCCACTGTTTATTAGCGACTTCAACCGTGTACGGCTGGAGTTTGTCGGCCAT  >  W3110S.gb/3948287‑3948340
     |                                                
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 aCCCGCTGTTTATTACTGATTTCAACCGTGTGCGGCTGGAGTTTGTCGGCCAt  <  1:589504/53‑1 (MQ=25)
  cccGCTGTTTATTACTGATTTCAACCGTGTGCGGCTGGAGTTTGTCGGCCAt  <  1:468066/52‑1 (MQ=25)
     |                                                
AACCCACTGTTTATTAGCGACTTCAACCGTGTACGGCTGGAGTTTGTCGGCCAT  >  W3110S.gb/3948287‑3948340

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑