Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,029,094 A→G L137L (CTA→CTG yhhS → predicted transporter

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,029,0940AG100.0% 704.5 / NA 240L137L (CTA→CTGyhhSpredicted transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (0/240);  total (0/240)

Only 100 of 240 total aligned reads displayed.

GATCGACCCTATGGGGCGTTGGCGTGGTTGGCTCGCTGCATATCGGGCGGGTGATTTCGTGG  >  W3110S.gb/4029084‑4029145
          |                                                   
gagcGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:930051/59‑1 (MQ=255)
gagcGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:840933/59‑1 (MQ=255)
gATCTACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1288618/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGttg  <  1:1089044/62‑3 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:354946/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:597506/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:591428/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:540968/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:52636/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:503017/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:489014/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:46760/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:42367/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:387184/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:385260/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:372090/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:362096/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:639685/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:343529/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:337925/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:321996/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:298661/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:287656/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:272643/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:270363/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1004781/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:249378/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:765829/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:98262/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:974558/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:932880/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:920844/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:899507/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:864830/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:853860/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:822190/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:797355/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:788430/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:615560/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:752409/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:738193/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:733751/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:727577/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:71535/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:690368/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:672293/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:664414/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:257571/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:632413/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1314158/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1409196/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1396384/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:239894/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1366876/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1353006/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1349770/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1348134/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1333893/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1325801/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1324033/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1320273/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1375003/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1274786/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1240020/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1234734/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1220538/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1162197/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1147740/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1118747/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1056323/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1038770/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1007730/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1439246/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:197441/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:173380/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1635663/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1631890/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1618219/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1608375/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1597215/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:157141/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1558666/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1527971/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1435484/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1442791/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1491795/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1488158/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1521230/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1467498/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1480845/62‑1 (MQ=255)
gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATAGGGCGGGGGATTTCGTgg  <  1:1502378/62‑1 (MQ=255)
 aTCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:856925/61‑1 (MQ=255)
 aTCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:947517/61‑1 (MQ=255)
 aTCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1642699/61‑1 (MQ=255)
 aTCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:667867/61‑1 (MQ=255)
 aTCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1210601/61‑1 (MQ=255)
 aTCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:837073/61‑1 (MQ=255)
 aTCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:420163/61‑1 (MQ=255)
 aTCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1534884/61‑1 (MQ=255)
    gACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1245273/58‑1 (MQ=255)
          |                                                   
GATCGACCCTATGGGGCGTTGGCGTGGTTGGCTCGCTGCATATCGGGCGGGTGATTTCGTGG  >  W3110S.gb/4029084‑4029145

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: