Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,029,100 C→T G139G (GGC→GGT yhhS → predicted transporter

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,029,1000CT100.0% 691.2 / NA 240G139G (GGC→GGTyhhSpredicted transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/240);  total (0/240)

Only 100 of 240 total aligned reads displayed.

GATCGACCCTATGGGGCGTTGGCGTGGTTGGCTCGCTGCATATCGGGCGGGTGATTTCGTGG  >  W3110S.gb/4029084‑4029145
                |                                             
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gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:489014/62‑1 (MQ=255)
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gATCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:387184/62‑1 (MQ=255)
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 aTCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:837073/61‑1 (MQ=255)
 aTCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:420163/61‑1 (MQ=255)
 aTCGACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1534884/61‑1 (MQ=255)
    gACCCTGTGGGGTGTTGGCGTGGTTGGTTCGCTACATATCGGGCGGGTGATTTCGTgg  <  1:1245273/58‑1 (MQ=255)
                |                                             
GATCGACCCTATGGGGCGTTGGCGTGGTTGGCTCGCTGCATATCGGGCGGGTGATTTCGTGG  >  W3110S.gb/4029084‑4029145

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: