Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	4,031,033	G→A	T56T (ACC→ACT)	yhhQ ←	conserved inner membrane protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	4,031,033	0	G	A	100.0%	220.8 / NA	79	T56T (ACC→ACT)	yhhQ	conserved inner membrane protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (79/0);  total (79/0)

CGGTCAGGTCGGTAGCAAGAAAAATAAACGGAAAGCTAAACGCGCCCCAGGTGGTATGGAA  >  W3110S.gb/4031023‑4031083           |                                                   ctgtcaggtcagTAGCGAGAAAGATAAACGGAAAGCTAAACGCGCCCCAGGTGGTATGaaa  >  1:977070/3‑61 (MQ=255) cGGTCAGGTCAGTAGCGAGAAATATAAACGGAAAGCTAAACGCGCCCCAGGTGGTATGaaa  >  1:119693/1‑61 (MQ=255) cGGTCAGGTCAGTAGCGAGAAAGATAAACGGAAAGc                           >  1:658900/1‑36 (MQ=37) cGGTCAGGTCAGTAGCGAGAAAGATAAACGGAAAGCTAAAcg                     >  1:1226556/1‑42 (MQ=255) cGGTCAGGTCAGTAGCGAGAAAGATAAACGGAAAGCTAAACGCGccc                >  1:1104698/1‑47 (MQ=255) cGGTCAGGTCAGTAGCGAGAAAGATAAACGGAAAGCTAAACGCGCCCCAGGTGGTATgaac  >  1:455393/1‑58 (MQ=255) cGGTCAGGTCAGTAGCGAGAAAGATAAACGGAAAGCTAAACGCGCCCCAGGTGGTATgaa   >  1:647188/1‑58 (MQ=255) cGGTCAGGTCAGTAGCGAGAAAGATAAACGGAAAGCTAAACGCGCCCCAGGTGGTATgaa   >  1:1159719/1‑58 (MQ=255) cGGTCAGGTCAGTAGCGAGAAAGATAAACGGAAAGCTAAACGCGCCCCAGGTGGTATgaa   >  1:1371140/1‑58 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑