Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	4,284,760	C→T	L397L (CTG→TTG)	yjcE →	predicted cation/proton antiporter

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	4,284,760	0	C	T	100.0%	43.3 / NA	18	L397L (CTG→TTG)	yjcE	predicted cation/proton antiporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/18);  total (0/18)

TGCTCTTGCCGGATGGTAACGTCTTCCCGGCGCGCTATGAGCTGGTGTTCCTGGCGGCTGGC  >  W3110S.gb/4284719‑4284780                                          |                     ttctctTGCCGGATGGTAACGTCTTCCCTGCGCGCTATGAGTTGGTGTTCCTGGCGGCTGGc  <  1:998351/60‑1 (MQ=255) ttctctTGCCGGATGGTAACGTCTTCCCTGCGCGCTATGAGTTGGTGTTCCTGGCGGCTGGc  <  1:805786/60‑1 (MQ=255) ttctctTGCCGGATGGTAACGTCTTCCCTGCGCGCTATGAGTTGGTGTTCCTGGCGGCTGGc  <  1:737655/60‑1 (MQ=255) ttctctTGCCGGATGGTAACGTCTTCCCTGCGCGCTATGAGTTGGTGTTCCTGGCGGCTGGc  <  1:545452/60‑1 (MQ=255) ttctctTGCCGGATGGTAACGTCTTCCCTGCGCGCTATGAGTTGGTGTTCCTGGCGGCTGGc  <  1:503617/60‑1 (MQ=255) ttctctTGCCGGATGGTAACGTCTTCCCTGCGCGCTATGAGTTGGTGTTCCTGGCGGCTGGc  <  1:345418/60‑1 (MQ=255) ttctctTGCCGGATGGTAACGTCTTCCCTGCGCGCTATGAGTTGGTGTTCCTGGCGGCTGGc  <  1:1046715/60‑1 (MQ=255) ttctctTGCCGGATGGTAACGTCTTCCATGCGCGCTATGAGTTGGTGTTCCTGGCGGCTGGc  <  1:466321/60‑1 (MQ=255) ttctctTGCCGGATGGTAACGTCTTCCATGCGCGCTATGAGTTGGTGTTCCTGGCGGCTGGc  <  1:721662/60‑1 (MQ=255) ttctctTGCCGGATGGTAACGTCTTCCATGCGCGCTATGAGTTGGTGTTCCTGGCGGCTGGc  <  1:482201/60‑1 (MQ=255) ttctctTGCCGGATGGTAACGTCTTCCATGCGCGCTATGAGTTGGTGTTCCTGGCGGCTGGc  <  1:1579720/60‑1 (MQ=255) ttctctTGCCGGATGGTAACGTCTTCCATGCGCGCTATGAGTTGGTGTTCCTGGCGGCTGGc  <  1:1532584/60‑1 (MQ=255) ttctctTGCCGGATGGTAACGTCTTCCATGCGCGCTATGAGTTGGTGTTCCTGGCGGCTGGc  <  1:1521559/60‑1 (MQ=255) ttctctTGCCGGATGGTAACGTCTTCCATGCGCGCTATGAGTTGGTGTTCCTGGCGGCTGGc  <  1:1385269/60‑1 (MQ=255) ttctctTGCCGGATGGTAACGTCTTCCATGCGCGCTATGAGTTGGTGTTCCTGGCGGCTGGc  <  1:1309422/60‑1 (MQ=255)  tctctTGCCGGATGGTAACGTCTTCCCTGCGCGCTATGAGTTGGTGTTCCTGGCGGCTGGc  <  1:344961/60‑1 (MQ=255)  tctctTGCCGGATGGTAACGTCTTCCCTGCGCGCTATGAGTTGGTGTTCCTGGCGGCTGGc  <  1:59045/60‑1 (MQ=255)                gTAACGTCTTCCATGCGCGCTATGAGTTGGTGTTCCTGGCGGCTGGc  <  1:1330195/47‑1 (MQ=38)                                          |                     TGCTCTTGCCGGATGGTAACGTCTTCCCGGCGCGCTATGAGCTGGTGTTCCTGGCGGCTGGC  >  W3110S.gb/4284719‑4284780

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑